Zend.
lo mejor para programar con zend es hacerse con la zf tool, registrar los providers que sean necesarios por ejemplo en zodeken que te hace los CRUD directamente leiendo todo de la database
tambien hay que hacerse unos templates para las tablas etc de forma que se mantenga la coherencia grafica del site.

http://framework.zend.com/manual/1.12/en/manual.html
https://www.youtube.com/watch?v=Ij49y4ikgag
http://www.andsoitcontinues.com/writing/setting_up_phpunit_and_netbeans_7_4.html
https://www.youtube.com/watch?v=_GXApT5tib4
http://framework.zend.com/manual/1.12/en/zend.db.adapter.html
http://www.webpixel.gr/blog/zend-quickstart-tutorial/5
http://mattmccormick.ca/2010/04/24/how-to-easily-create-models-and-table-relationships-in-zend-framework/
http://bigemployee.com/zend-framework-2-pagination-sorting-tutorial/
https://github.com/zendframework/zf2/issues/4442
http://stackoverflow.com/questions/3941166/zend-application-ini-resourse-for-different-modules
http://nickbartlett.com/zend-framework-how-to-autoload-forms-within-a-module/
https://akrabat.com/bootstrapping-modules-in-zf-1-8/
http://framework.zend.com/manual/1.12/en/project-structure.filesystem.html

para el entorno de develop lo mejor es seguir lo que pone en la misma doc cuando te bajas el zend framework, alli viene como crear un virtual con vagrand y con eso va que chuta
luego el tema de la configuracion de eclipse o de netbeens no lo tengo aun resuelto